空间转录组云流程操作指南

基础模块

• 第1节

  报告解读

• 第2节

  新手指南

• 第3节

  项目概览

• 第4节

  基本信息

• 第5节

  项目管理

• 第6节

  原始数据统计与质量评估

• 第7节

  SpaceRanger测序数据统计

• 第8节

  Spot质量评估与过滤

实战模块

• 第9节

  PCA降维分析

• 第10节

  聚类分析与可视化

• 第11节

  Cluster特征基因分析

• 第12节

  数据集注释

• 第13节

  Marker基因注释-基于软件

• 第14节

  Marker基因可视化-手动注释

• 第15节

  细胞类型可视化

• 第16节

  细胞亚群降维聚类分析

• 第17节

  Subcluster特征基因分析

• 第18节

  细胞类型差异分析

拓展模块

• 第19节

  拟时序分析stlearn

• 第20节

  细胞通讯分析

• 第21节

  MIA分析

• 第22节

  RCTD分析

• 第23节

  SPOTlight分析